编译构建

Crystal MD使用CMake工具进行编译构建，如果你不熟悉CMake，可以参考CMake的相关文档。 在正式进行构建之前，确保你的系统已经安装并配置了CMake工具、相符版本的c++编译器、MPI环境等， 且确保已经正确配置了环境相关变量(如CC CXX环境变量)。

1.使用CMake工具编译

我们强烈推荐使用CMake外部构建(out-of-source build)方式进行构建：

cd $MD_PATHcmake -B./build -H./cmake --build ./build -j 4  # build using 4 processors.

执行以上步骤后，编译完成的可执行Crystal MD程序会放在$MD_PATH/build/bin目录。

2.构建选项

如果你需要将编译完成的二进制文件安装到指定目录，可以用以下命令进行构建,并安装：

cd $MD_PATHcmake -B./build -H./ -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/your/desirable/path/cmake --build ./build -j 4cmake --build ./build --target install # install

在执行cmake命令的时候，除了可以指定CMAKE_INSTALL_PREFIX等CMake构建工具内置的参数外，还可以指定以下参数：

参数	取值	默认值	说明
TEST_ENABLE_FLAG	ON/OFF	ON	是否构建test (单元测试)

例如，如果你不希望构建单元测试tests目录，可以使用如下的命令进行构建：

cd $MD_PATHcmake -B./build -H./ -DTEST_ENABLE_FLAG=OFF -DTOOLS_BUILD_ENABLE_FLAG=OFFcmake --build ./build -j 4